Lancet Oncol:肾透明细胞肝癌与肥胖悖论相关的转录组特征分析

2021-12-27 02:54:04 来源:
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一.科学研究背景

老年人与脾粉红色线粒体肝癌 (ccRCC)的不确定性增加有关,但老年人又矛盾地与该的预后优化有关,其潜在选择性亦然不明确。原是编者对老年人病症和但会腰围病症在原发和瘤周脂肪两组织两组织中都的肺以外解和免疫转录两组相似之处进行科学研究归纳。

本文介绍了基因序列详见达引起的微环境的相似之处有助于断言老年人病症的求生存优势(老年人悖论)。

二.归纳工序三.文章讲解1.COMPARZ数据资料流、TCGA-KIRC数据资料流、MSK免疫用药数据资料流数据资料查阅、矫正

在COMPARZ数据资料流的453名病症中都,有375名(83%)病症有着可用的微阵列数据资料,用药从前BMI精确测量以及无进展和上都求生存数据资料进行归纳(详见1)。除119名(26%)太重病症外,来自COMPARZ试验的最终数据资料流还包括256名(68%)病症(n=256)。

详见1.COMPARZ药理学试验数据资料流的人口减少数据分析和药理学相似性

TCGA-KIRC数据资料流中都的332事例病症中都,评量了经脾切除绝技用药的152事例(46%)早期(即AJCC III和IV期)ccRCC病症的药理学和人口减少数据分析数据资料(详见2)。在意味著59名(39%)太重病症后,最后获的数据资料流还包括93名病症(n=93)。

详见2.早期粉红色线粒体脾线粒体肝癌TCGA-KIRC数据资料流的密切相关和药理学相似性

从62事例MSK远处脂肪两组织两组织数据资料流中都进行脾脏切除绝技的非结核粉红色线粒体RCC病症中都获了原发性和远处脂肪两组织样品。在这个数据资料流中都,从59名病症的PNN(脾周附近)远处脂肪两组织,25名病症的PNA(远离脾周)远处脂肪两组织以及55名病症的两组织中都取样。在意味著太重病症后来,最终数据资料流还包括41名(69%)PNN抽样病症, PNA抽样为17(68%),抽样为37(67%)。从最初的203名两组织者的MSK免疫用药科学研究年轻人中都意味著74名(36%)太重病症后,总求生存归纳的最终数据资料流还包括129名(64%)两组织者(详见3)(n=129)。

详见3. 采用MSK免疫用药的药理学试验数据资料流的人口减少数据分析和药理学相似性

2.老年人的脾粉红色线粒体肝癌病症值得注意但会腰围的脾粉红色线粒体肝癌病症总求生存期更慢

根据KM求生存归纳,在三两组中都都发原是老年人病症的总求生存期更慢。在TCGA-KIRC数据资料流中都,经分期校正后,老年人病症的上都存活期见长但会腰围两组;在COMPARZ数据资料流中都,经IMDC不确定性评级校正后,胖病症的上都存活期也见长但会腰围两组。在MSK免疫疗法数据资料流中都,经IMDC不确定性评级校正后,BMI与死亡率的无特别是在相似之处(如所示1)。

所示1.TCGA-KIRC数据资料流 (A)、COMPARZ 数据资料流(B)和MSK免疫用药数据资料流(C)的总求生存期

3.COMPARZ数据资料流中都老年人病症有着更佳的PFS

对CPMPARZ数据资料流KM归纳后,KM双曲线表明,COMPARZ数据资料流中都老年人病症比但会腰围病症有着更佳的PFS。

所示S1.COMPARZ数据资料流中都老年人病症比但会腰围病症有着更佳的PFS

4.用作一线本品用药,老年人病症仍有着更佳的OS

KM双曲线表明了在用作一线过氧化物激酶类固醇(pazopanib或Sunitinib)的两个用药两组中都,老年人病症的OS始终较但会腰围病症好。

所示S2.COMPARZ数据资料流用作一线本品用药两组的总求生存期归纳

5.COMPARZ数据资料流中都,老年人与但会腰围的病症转录两组基因序列相似性不存在特别是在相似之处

再来上述归纳,编者在三个数据资料流中都确认老年人悖论不存在后来,接下来在COMPARZ数据资料流中都对老年人和但会腰围病症评量了转录两组学相似之处。后于做了Hallmark基因序列集的GSEA归纳,更为老年人病症与但会腰围病症之间的相似之处:老年人病症中都表明高热、TGF-β、内膜-间充质改变和肺以外解路径渠道特别是在上调,提示皮肤上愈合必需的激活(所示A)。所示B是对所示A筛选的几个基因序列详见达渠道的Enrichment plots。

所示S4.COMPARZ数据资料流中都老年人病症与但会腰围病症的ccRCC转录两组基因序列相似性不存在特别是在相似之处

6.COMPARZ数据资料流与TCGA-KIRC数据资料流 中都老年人比但会腰围病症的肺以外解评级极低

在GESA衍生的相似性基因序列集肺以外解评级更为中都,老年人病症很低但会腰围病症(如所示2)。

所示2.COMPARZ数据资料流(A)与TCGA-KIRC数据资料流 (B)中都老年人原发病症与但会腰围病症的肺以外解的z score

7.但会腰围与老年人病症的免疫线粒体;也无特别是在相似之处

对但会腰围(7事例)与老年人(16事例)病症的原发的主要免疫线粒体数目仅有采用流式线粒体绝技进行评量。所示A表明了老年人病症与但会病症之间的免疫线粒体;也的上都相似之处。所示B明确表明了老年人和但会腰围病症T线粒体;也的显现显露来水平。发原是但会腰围与老年人病症的免疫线粒体;也无轻微相似之处,免疫线粒体显现显露来的某种程度与BMI比如说。

所示S9.用流式线粒体绝技归纳但会腰围与老年人病症的免疫线粒体;也无轻微相似之处

8.与但会腰围病症相比较,老年人病症瘤周脂肪两组织两组织黏膜增加,尤其是附近的瘤周脂肪两组织

在MSK的非结核ccRCC病症的从前瞻性数据资料流中都,编者合并了20个最特别是在的丰富的IPA规范渠道,这些渠道来自于老年人和但会腰围病症的PNN和PNA抽样的更为(所示A)。老年人和但会腰围病症的PNN和PNA抽样之间的免疫显现显露来(ssGSEA评级)更为(所示B)。

所示S5.与但会腰围的病症相比较,老年人病症的脾周脂肪两组织表明显露黏膜和高热增加

综上,在COMPARZ试验数据资料流中都,经过IMDC不确定性评级修正后,发原是值得注意但会腰围病症,过氧化物激酶类固醇用药提极低了老年人病症的求生存率,特别是给与sunitinib用药的病症。IMDC不确定性评级模型包含的两组分间接反映寄生物因素对肝癌症系统性黏膜起着(事例如贫血,中都性粒线粒体增多,和骨髓增多症),这些因素可能也是免疫用药结果和BMI之间关联性选择性的原因。发原是老年人病症的肺以外解分数很低但会腰围病症,与之从前其他的科学研究结果详见明的,参与肺以外解,β-硫酸必需等等基因序列的富集的原是象一致。因此,肺以外解的相似之处可以以外断言老年人病症给与过氧化物激酶类固醇用药后的极好预后。

此科学研究为老年人悖论发放了生物学支持。在脑癌ccRCC的病症观察到老年人病症值得注意但会腰围的病症微环境的相似之处:特别是老年人病症的的肺以外解增加,但上都黏膜无轻微相似之处。特别注意的是老年人病症的远处脂肪两组织表明增加的黏膜和高热状况。粉红色线粒体肝癌与瘤周脂肪两组织两组织微环境的简单相互起着可能有着药理学意义,特别进一步科学研究。

完整显露处:

Sanchez A, Furberg H, Kuo F, Vuong L, Ged Y, Patil S, Ostrovnaya I, Petruzella S, Reising A, Patel P, Mano R, Coleman J, Russo P, Liu CH, Dannenberg AJ, Chan TA, Motzer R, Voss MH, Hakimi AA. Transcriptomic signatures related to the obesity paradox in patients with clear cell renal cell carcinoma: a cohort study.Lancet Oncol. 2020 Feb;21(2):283-293

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